距今3萬年前，地球上曾經存在著擁有高度文明的兩塊大陸，一為愛好和平以大白鯨作為守護神的吉睦大陸，另為天生野蠻只崇尚武力窮兵黷武的亞特蘭斯大陸，其帝王查爾根以‘熱能元素’自恃懷揣而發動了戰爭。吉睦的領導者那睦深知雙方若引發全面交戰，恐怕只會使地球遭致毀滅一途，便用竭盡己力將亞特蘭斯送往異次元，而吉睦也因此而沉沒至海中……。西元1982年3月，太陽系的行星呈現一直線的排列，致使地球上世界各地相繼出現空前未有的災難。事實上此乃事出有因，一切全歸咎于亞特蘭斯大陸的重現，這次擁有強大科技武力的他們卻是想要征服地球。而對此早有預料的那睦事先將頭腦移植至大白鯨上一同蘇醒，號召一群與吉睦有淵緣的年輕人在伊斯塔島集合，與其女兒瑪諾娜合力向亞特蘭斯帝國展開一場不屈不撓的戰斗。