故事講述的是從東京都西部被分割出來的這座都市中，超能力開發被列為學校課程的一部分。在二百三十萬人口中，有八成都是學生，所以被稱為學園都市。他們每天都在超能力開發上進行相互競爭。根據能力不同，可以分為5級，從無能力到超能力。故事的主人公上條當麻是學園里的一個無能力者，但并非完全沒有能力，而是他的能力是能夠將一切異能效果無效化。他只有右手能夠使用這種能力，還給自己的這種連上帝的奇跡都能抹殺的能力取...