清乾隆年間，江南武林紅花會總舵主于萬亭帶同四當家文泰來夜闖清廷禁宮。總舵主于萬亭見過乾隆后，遭清兵毒手，死前立下遺命，由年輕義子陳家洛接任總舵主之位，紅花會上下準備最隆重的接任大禮。　　隱身于陜西扶風延綏鎮總兵李可秀家為西賓的武當派名宿陸菲青，隨主人新遷浙江水陸提督前往江南的途中，遇上并參加儀式，卻被朝廷鷹爪困在三道溝客棧，被文泰來等相救，將他們薦至周仲英處避難。　　適逢周仲英外出，朝廷鷹爪尾隨前來，激戰之余，文泰來被捕，駱冰與余魚同逃出。周仲英外出歸來，惱怒異常，紅花會眾英雄趕來鐵膽莊，因誤以為文泰來被出賣，雙方交手，混戰一場。紅花會新任總舵主陳家洛趕來以百花錯拳勝周仲英，后得知周仲英之子只有十歲，才知錯怪對方，握手言和。　　為救文泰來，眾英雄堵截鏢行車隊與為搶回圣物的一部落相遇，陳家洛出手相救，與霍青桐彼此惺惺相惜，并肩作戰，幾經波折，終于為霍青桐取回圣物。李沅芷女扮男裝前來助戰，與霍青桐歡笑戲鬧，陳家洛以為霍青桐心有所許，霍青桐知陳家洛誤會，一時間難解釋明白，告辭而歸，臨行前將自己珍藏的一把短劍贈送給陳，并言其中隱藏著一個大秘密。　　陳家洛游西湖之時，與自稱東方耳的乾隆相識，后雙方比武，乾隆被擊敗，惱羞成怒。陳家洛得空回老家祭掃父母之墳，卻意外遇見在這里偷偷掃墓的乾隆，雙方約定互不傷害。陳家洛從文泰來處得知乾隆是自己的親哥哥，物證在陳家洛的師父天池怪俠那里之時，張召重返回，二人出奇不意，點中穴位，將其擊倒，文泰來遂假扮張召重而出，被李可秀識破，陳家洛只好獨身而返。陳家洛等借花船點狀元之機，設計使名妓玉如意將乾隆引至家中捉住，囚在六和塔中，軟硬兼施，情威并用，與乾隆一同訂下驅清復明的大計。只有趕來刺殺乾隆的天山雙鷹夫妻二人決不相信皇帝，不參加盟誓。　　為反清復明，眾人四散聯絡人手。余魚同為避李沅坐船獨行，遇上關東三魔及仇人言伯干等，幾次遇險，仗機警逃出，虧得李沅芷假扮他引開眾人，才得脫險。陳家洛為送信，單騎匹馬趕往西疆，途中遇見人稱香香公主未知是霍青桐之妹，為其美麗所吸引，香香公主也愛上了陳家洛。　　霍青桐識破清軍陰謀，大敗清軍。勝后，霍青桐帶病出走，途遇關東三魔，險遭污辱，幸得師父天山雙鷹趕到救出。陳家洛此時方知李沅芷女扮男裝，后悔自己辜負了霍青桐的一片芳心，與香香公主一同追趕，途中先后遇見狼群和張召重、關東三鷹、霍青桐，眾人為抗惡狼暫時聯手。陳家洛用霍青桐贈送他的短劍殺狼時，碰巧解開了其中的秘密，遂和霍青桐、香香公主逃出狼群，躲入迷城古洞，并得了一套奇高的武功。電視劇書劍恩仇錄劇照　　陳家洛師父袁士霄為消滅群狼，設置一土城，用牛、馬等將狼群引入城中。陳家洛用新學武功打敗張召重，將其投入狼群之中。其間余魚同得知師父馬真被張召重所害，脫下袈裟誓為師父報仇，李沅芷借其報仇心切，設計陸菲青從中撮合，二人終于訂下終身。　　陳家洛從師父處取得有關乾隆身世的秘證，南下福建少林寺，欲了解義父被逐出少林的原因，經過連場比試，憑借武功與機智，弄清了全部事實真相。　　香香公主被擒，乾隆欲據為已有，陳家洛與乾隆相見，以國家利益為重，答應幫助勸說香香公主;香香公主含淚答應了陳家洛，后發現乾隆并不真想反清復明，遂自殺示警，陳家洛傷心之余，抱著最后一線希望進入皇宮，險被毒死。眾英雄大開殺戒，天山雙鷹與紅花會十當家章進身亡，最后捉住乾隆。　　霍青桐正欲殺之為父、兄、妹及族人報仇時，安徽巡撫方有德突然抱嬰兒出現。原來他與侍衛火燒福建少林寺搶得周綺之子來京向乾隆報功。他以嬰兒性命相威脅，眾人不忍見嬰兒死于非命，遂放棄殺乾隆之念，活捉乾隆之私生子福康安出宮，迫使乾隆不與紅花會為難。眾人趕至香香公主之墳，打開后只見一灘碧血，香香公主的尸體已化作一縷香魂，陳家洛揮毫題上《香冢》詩詞，并作銘后凄然而去，與紅花會眾英雄前往西疆棲身。