新西歷1999年，一個超級電腦主程式感染了病毒，此電腦病毒具有自我，轉眼間占據了能源管理局的主控電腦并開始狂飆；人類只好選擇把整棟能源管理局都轉移到異空間。在這同時，人類也因此得到了新的能源“Enetron”（創）。另一方面，這事件也讓3名在轉移異空間前逃離能源管理局的少年少女，以及3臺工作機器人的命運產生很大的變化。13年后的新西歷2012年，Enetron已經成為人類日常生活中的必備能源?？墒?，當年那個被轉移到異空間的電腦病毒卻又再次回到了這個世界。任命前往克服這個危機的，便是13年前的事件后得到了特殊力量的3名“Busters”，和得到了自我的3臺原本用于輔助工作的機器人“Buddyroid”。他們就是接受了“守護人們”的這個“特命”而戰的戰士——“特命戰隊GoBusters”！