<p>　　「思い出して、翅（はね）があったころのことを」<br/>　　1萬2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。<br/>　　太陽と月と火星が出會うとき、新たな合體の調べが流れる──！<br/>　　湘南の海に浮かぶ小島、江の島。<br/>　　美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島學園〉はある。<br/>　　學園には、全國から優秀な子どもが集められ、<br/>　　最新の機器を使った英才教育が施されていた。<br/>　　特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、<br/>　　感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、<br/>　　謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。<br/>　　戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。<br/>　　「想星合體！　GO、アクエリオン！」<br/>　　繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。<br/>　　宿命を背負った少年少女は、<br/>　　得體のしれない団體〈宇宙たまごの會〉や大人たちの思惑が交錯する中、<br/>　　この宇宙の真実と向き合っていくことになる……。<br/>　　これは、おのれの感情と宇宙の存亡を賭けて紡がれる、壯大な愛の神話。</p>