本劇講述1937年南京大屠殺的四十九日里發生的故事。日本軍隊進入淪陷的南京城，奉命掩埋中國死難士兵和戰俘尸體。與此同時，市中心的圣馬德倫教堂中迎來了一群不速之客，十來個女學生和秦淮河女子，她們殊途同歸只為同一件事――逃難。緊接著許多男人也因為各種原因進入了教堂。　　圍墻外的日軍尋找各種借口進入教堂，圣馬德倫教堂的后院成為他們填埋尸體掩蓋罪證的目標，國際安全區的組織者嘗試各種解救教堂被困人員的方案，卻屢屢失敗。　　教堂中的男人們為了保護藏在教堂閣樓和地窖中的女人，獻出了自己的生命，女人們或者選擇了有尊嚴地死去，或者進行了最壯烈的抵抗。　　在這四十九個日夜里，他們和他們，在一次次地求生、抵抗、毀滅和復活中締結了愛情、親情和友情，曾懦弱地變成了勇士、曾迷失的找到了方向、曾虛無的得到了收獲、曾有罪的完成了救贖。四十九日·祭劇照　　改編自嚴歌苓長篇小說《金陵十三釵》的電視劇《四十九日·祭》講述了南京被日軍攻占后，49日內發生的人間慘劇，反映了絕境中的生命意義與人性救贖。此外，在尊重原著基礎上，《四十九日》也有所創新：不再是兩個女性群體的命運互換，而是多個群體的逃生故事;外國的神無法救中國的人;亂世佳人情感碰撞;新加入的軍人形象更有熱血等。對此，導演張黎也曾表示說：“我們希望打撈歷史，在大悲劇中挖掘生命的本質，真實還原人性的選擇和情感力量。”宋佳飾演的玉墨在劇中沒有凋零，而是作為戰后幸存者參與了大屠殺清算;電影版的外國神父角色將由白玉蘭視帝張嘉譯演出;新加入的軍人形象更有熱血，由胡歌飾演的陸軍少尉戴濤將與小宋佳飾演的玉墨展開一段壓抑又凄美的感情故事。