黃飛鴻是嶺南武術界的一代宗師，也是一位濟世為懷，救死扶傷的名醫，他的一生充滿了傳奇。早年他在臺灣浴血奮戰，與劉永福領導的黑旗軍和臺灣當地的賽德克族勇士共同抗擊侵略的日軍，成為了保家衛國的蓋世英雄。回到廣州，開設"寶芝林"，卻走上一條行醫不授武的修心之路。然而，永無止息的江湖爭斗還是將他逼到了不得不出手的生死絕境，卻也讓他登頂武者之王。他被冠上了俠者光環，受人敬仰；可是刺殺貪官的黑暗英雄"鐵馬騮"竟在此時重現江湖。代表光明和黑暗的兩位英雄之間必有一戰。然而，在這場英雄理念之爭的背后竟還隱藏著一連串的驚天陰謀，這三場曠世之戰，終于使黃飛鴻成為了戰無不勝的國士無雙······