前任院長蛭間重勝（西田敏行飾）被趕走一年后，東帝大學(xué)醫(yī)院誕生了第一位女性院長，她提出“患者優(yōu)先”的口號，開始進(jìn)行大刀闊斧的開革，清除醫(yī)局的腐敗。但是盤踞在醫(yī)院的當(dāng)權(quán)者們?yōu)榱藠Z回自己的利益，復(fù)興以絕對權(quán)力和森嚴(yán)等級統(tǒng)馭的“黑色巨塔”，開始暗中活動。左遷至東帝大學(xué)醫(yī)院知床分院的蛭間重勝也蠢蠢欲動。天才的外科醫(yī)生大門未知子（米倉涼子飾）與被污染的醫(yī)療組織展開正面對決。
未知子病倒
從未失敗過、一直致力于挽救患者生命的未知子自己病倒了。晶叔和博美都非常擔(dān)心她。這時，醫(yī)療界的領(lǐng)袖、“日本醫(yī)師協(xié)會”會長內(nèi)神田景信得了食道癌，準(zhǔn)備在東帝大做手術(shù)。內(nèi)神田的病情極重，除了未知子以外無人能成…
內(nèi)神田景信暗地活動 準(zhǔn)備將未知子清除出醫(yī)學(xué)界
城之內(nèi)博美的女兒在芭蕾舞教室的同學(xué)九重遙與祖父九重節(jié)郎一起來到東帝大學(xué)醫(yī)院。芭蕾舞選拔賽舉行在即，但是小遙的腳痛得受不了，所以來醫(yī)院檢查。幸好，檢查結(jié)果表明她得的是不太嚴(yán)重的炎癥。然而，未知子暗示小遙…
