《聰明的順溜之雄鷹小子2》由兩條主線交叉進行。一條主線是順溜在演習中受了重傷，被調到軍事夏令營，成為了五個孩子的教官。在夏令營中，順溜與孩子們從開始的互相看不上、不搭理，到互相“斗法”，漸漸的順溜在與孩子們的交往過程中發現了自己的錯誤，學會了換位思考、征詢他人意見，孩子們也從順溜身上看到了軍人的品格，對部隊有了新的認識，并且成為朋友，共同成長。而另一條主線，保留了第一季的發展，尚譽、包打聽、高超與選出的三個戰士，五人一行進入神秘的魔鬼島，與集團軍陸軍其他戰隊一起進行淘汰特訓，從中選出五人戰隊與空軍、海軍戰隊比武，最終組成戰區陸海空五人聯合戰隊。故事的最后，兩條主線匯合。順溜五人與軍事夏令營的五個孩子，接到命令去完成一項特殊任務。科研部門開發出大型仿真軍史國防VR訓練系統，他們的任務是進入系統完成系統給予的任務。十人通過重溫軍史，順溜五人領會到軍人的使命是為中華民族復興而戰、五少年領悟到他們的目標是為中華崛起而學習。順溜五人組成“雄鷹戰隊”繼續參加戰區選拔賽。