在上一季結尾擎天柱打敗震天尊之后，擎天柱留下與大黃蜂一行繼續捉拿四散在地球上的霸天虎逃犯。然而，擎天柱因被微米取走了作戰時超級領袖借給他的火種，而變得異常虛弱。同時，他與大黃蜂在管理團隊、布置戰略戰術上不時地產生分歧。另一方面，在汽車人追捕逃犯的過程中，不斷發現在黑面神的霸天虎逃犯資料庫里沒有記錄的新面孔，原來當初黑面神所管轄的囚犯只是整個艾之墓監獄艦上的一小部分……