故事的主角是一個看起來非常普通的高中生男孩，他的名字就叫做“游戲”，他現在正被一種風靡全國的紙牌游戲深深吸引。然而他的對這種游戲的領悟顯然要比普通人深遠得多，當他玩他最喜歡的紙牌游戲時，他就立即變成了一個“游戲之王”。怪獸之決斗是以第一部動畫為藍本，以卡片怪獸決斗為主線，共分為七篇：決斗者王國篇（001—051集）、戰斗城市?前篇（052—097集）、乃亞篇（098—121集）、戰斗城市?后篇（122—144集）、杜馬篇（145—184集）、海馬集團大賽篇（185—198集）、王之記憶篇（199—224集）。