由于阿笠博士家的浴室出了故障，柯南隨同小蘭、灰原一同去大眾浴池洗澡，期間柯南不小心滑倒撞到頭部，隨后被兩名神秘的陌生人帶走。一番混亂后，天才詐欺師娜娜和神秘殺手近藤將失去記憶的柯南帶到某處隱蔽的別墅，并偽裝成他的父母，而追蹤近藤他們的阿笠博士和灰原則遭遇嚴(yán)重車禍，娜娜所屬的某個(gè)犯罪團(tuán)伙似乎打算利用柯南制造一起炸彈恐怖襲擊。與此同時(shí)，供職于某雜志的編輯水島早苗懷疑丈夫近藤有外遇，而找到毛利小五郎調(diào)查丈夫的行蹤。時(shí)間流逝，險(xiǎn)惡的陰謀浮出水面……