香港警務(wù)署轄下的精英部門-特別任務(wù)連(SDU)，俗稱飛虎隊，專責應(yīng)付香港所有最嚴峻、最困難的特別任務(wù)，包括協(xié)助警隊部門偵查嚴重罪案、對付悍匪及恐布分子、保護重要人物等。飛虎隊員必須經(jīng)過嚴格的挑選及艱辛的訓練，在體能、心理、團結(jié)及服從性等方面表現(xiàn)卓越，絕對是精英中的精英!　　人事幾翻新　感情現(xiàn)波瀾　　由指揮官展瀚韜(馬德鐘飾)領(lǐng)導的飛虎隊行動組A Team，經(jīng)過一年的合作和鍛鍊，各隊員漸見成熟，合作更具默契，而面對的新挑戰(zhàn)亦接踵而來。隨著舊拍檔相繼離隊，俞學禮(羅仲謙飾)等A Team成員搖身一變成大師兄，以身作則帶領(lǐng)一批九十後新隊員。當眾下屬認定瀚韜是升任總督察的最佳人選，總督察潘子龍卻由刑事情報科空降成為瀚韜的上司，眾隊員大表詫異之馀，亦要重新適應(yīng)子龍的新作風。　　瀚韜的「最佳拍檔」、飛虎隊狙擊手莊卓源(梁烈唯飾)，與女友丁慧慧(茍蕓慧飾)彼此認定為終身伴侶，但卓源卻發(fā)現(xiàn)慧慧舉動異常而不勝煩惱。原來慧慧為支持卓源、深入了解卓源的工作，竟辭去空姐一職。卓源感情生活穩(wěn)定，但工作上卻遇上樽頸。卓源在一次行動中擊斃匪徒後，若有所思，開始對開槍感猶疑，更萌生離開飛虎的想法……另一邊廂，一心成為女飛虎的蘇文強(黃智雯飾)，經(jīng)過多重辛苦訓練，終如愿如償。文強與學禮日久生情，二人正欲確認彼此關(guān)系時，學禮曾保護的富家女舒子麗再度出現(xiàn)，成為二人感情發(fā)展的牽絆?！　★w虎隊每次行動部署精密，但在一次行動中，一名飛虎隊員卻被指違反守則需接受聆訊。其他隊員對此忿忿不平，團結(jié)一致保護犯錯隊友，惟瀚韜公正不阿直斥其非。眾隊員有感瀚韜處事固執(zhí)，向來團結(jié)的A Team竟面臨四分五裂的危機，瀚韜如何化解……　　神秘女臥底 正邪兩難辨　　飛虎隊在一次拯救人質(zhì)行動中，匪徒執(zhí)意要見一名失蹤多時的刑事情報科女探員- 鍾韋恩(鍾嘉欣飾)，但韋恩早以音訊杳然。飛虎隊苦無對策下強攻拯救人質(zhì)又遇上困局，千鈞一發(fā)之際，韋恩突然出現(xiàn)，與瀚韜里應(yīng)外合，救出人質(zhì)?！　≡瓉眄f恩在臥底任務(wù)失敗後失蹤一年，希望重回刑事情報科，但必須經(jīng)過連串嚴格測試。瀚韜明白韋恩失蹤緣由，幫助她復職。韋恩重返刑事情報科，與瀚韜率領(lǐng)的飛虎合作無間，漸對瀚韜產(chǎn)生傾慕之情，惜瀚韜剛與在英國進修的女友莊卓樺分手，未能太快投入新感情，始終與韋恩保持一段距離。飛虎2海報　　飛虎隊與刑事情報科調(diào)查案件期間，韋恩被發(fā)現(xiàn)過程中有所隱瞞，令飛虎隊員身陷險境，引來眾飛虎隊員不滿，并質(zhì)疑其真正身份。瀚韜原本堅信韋恩為人正義、心地善良，但韋恩對瀚韜忽然若即若離，說話似真似假，種種跡象令瀚韜不禁懷疑她背後隱藏不可告人的秘密……　　迎戰(zhàn)悍匪幫 團隊受考驗　　瀚韜帶領(lǐng)的飛虎隊面臨分裂內(nèi)憂的同時，又要面對犯罪集團策動驚天罪案的外患，匪徒目標竟是警隊中人，瀚韜更一度身陷險境，究竟事件背後藏有甚麼陰謀?瀚韜與一眾隊員能否冰釋前嫌，憑藉飛虎精神，瓦解悍匪集團?經(jīng)歷隱瞞情報事件後，原與飛虎隊合作無間的韋恩與所屬的刑事情報科，還是否可靠合作夥伴?