地球上，一輛火車突然遭到外星生物入侵，整個列車都陷入癱瘓。關鍵時刻，一位神秘女子從天而降，及時阻止了正在跟蹤人類獵物的外星獵人！而這位神秘的女人其實就是經過重生忘記了身份的第十三任神秘博士，也是《神秘博士》有史以來第一位女博士！隨著英國謝菲爾德的人類受到威脅，博士招募了三個新朋友——性格溫和的瑞安、做事一絲不茍的小雅以及瑞安的繼祖父格雷厄姆。他們一起對抗邪惡的外星人、把被卷入太空的人類平安帶回地球、阻止時空秩序被擾亂和破壞、在樹林中追趕狡猾的邪惡生物……在共同經歷了這一段充滿活力、激情和刺激的冒險旅程后，四個人之間的關系感覺不再像同伴那么簡單，反而更像是一家人。第十三任博士也在她們的幫助下，終于找回了自己的身份和記憶。