第五季開始講述了一個比較完整的主線劇情和目的性，前幾季劇集之間關聯性不是很強，每一集可以當做一個單獨的故事看，而第五季開始就講述時間裂縫，神秘女人River，tardis的爆炸，The silence，當然還有Dalek和cyberman，其中層層嵌套的謎團，使得影迷們欲罷不能。
The Big Bang 宇宙大爆炸
接上集，博士一行找到了潘多拉，這時博士的所有敵人都到了，在潘多拉打開的時候，博士發現這個潘多拉是博士的敵人們聯合一起制造的陷阱，據他們所說，他們發現多元宇宙和時間的毀滅證據全都指向博士和他的塔迪斯。
The Pandorica Opens 潘多拉開啟
梵高在臨死前作畫要傳達給博士一些信息，此畫經過丘吉爾、宋河終于到達了博士手中，此畫預言了塔迪斯的毀滅。
