正式成為初中生的黑衣MATO在學校的入學式上，一眼就看中了她的同班同學——小鳥游YOMI。　　天真爛漫的MATO與帶有成熟味道的YOMI。　　這樣對應一般完全相反的兩個人，隨著一起度過的時間逐漸增多，兩人間的友情也變得更加堅固。　　可是升上初中二年級后兩人卻被分在了不同的班級，于是少女們的心終于開始了分歧。　　與此同時。　　在另一個世界里，眼中潛藏著藍色火焰的少女——BLACK★ROCK SHOOTER與她的宿敵——手持漆黑大鐮的少女，DEAD MASTER展開了激烈的死斗